Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms