Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP4Q8N2S1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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