Protein–RNA interactions for Protein: P62502

LCN6, Epididymal-specific lipocalin-6, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN6P62502 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCN6P62502 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCN6P62502 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCN6P62502 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCN6P62502 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCN6P62502 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCN6P62502 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCN6P62502 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms