Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPOP42166 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPOP42166 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPOP42166 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPOP42166 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPOP42166 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPOP42166 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPOP42166 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPOP42166 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPOP42166 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPOP42166 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPOP42166 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms