Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ThpoP40226 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms