Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX7O95931 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX7O95931 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX7O95931 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX7O95931 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX7O95931 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX7O95931 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms