Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PHF1O43189 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PHF1O43189 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHF1O43189 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHF1O43189 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHF1O43189 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHF1O43189 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHF1O43189 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHF1O43189 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHF1O43189 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF1O43189 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF1O43189 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF1O43189 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF1O43189 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF1O43189 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PHF1O43189 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PHF1O43189 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF1O43189 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF1O43189 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PHF1O43189 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF1O43189 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PHF1O43189 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF1O43189 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHF1O43189 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHF1O43189 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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