Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdccag3A2AIW0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdccag3A2AIW0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms