Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms