Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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