Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Snx5Q9D8U8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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