Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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TMIEQ8NEW7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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TMIEQ8NEW7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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TMIEQ8NEW7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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TMIEQ8NEW7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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TMIEQ8NEW7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms