Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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