Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn1Q08091 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Cnn1Q08091 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Cnn1Q08091 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms