Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Sdc2P43407 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Sdc2P43407 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Sdc2P43407 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Sdc2P43407 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Sdc2P43407 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sdc2P43407 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sdc2P43407 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Sdc2P43407 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Sdc2P43407 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Sdc2P43407 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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