Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPOP30536 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPOP30536 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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