Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms