Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms