Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd9Q9D9M4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms