Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORCS2Q96PQ0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SORCS2Q96PQ0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms