Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms