Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBP4Q8N2S1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBP4Q8N2S1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms