Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox17Q61473 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox17Q61473 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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