Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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