Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms