Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
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