Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Neurl1bQ0MW30 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms