Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPRP12270 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPRP12270 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPRP12270 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPRP12270 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPRP12270 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPRP12270 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPRP12270 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TPRP12270 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPRP12270 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPRP12270 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TPRP12270 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms