Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01878 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
P01878 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01878 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01878 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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