Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol6B7ZC55 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol6B7ZC55 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms