Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms