Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms