Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms