Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E330014E10RikQ3UL33 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms