Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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KncnQ307W7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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KncnQ307W7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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KncnQ307W7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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KncnQ307W7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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KncnQ307W7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KncnQ307W7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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KncnQ307W7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KncnQ307W7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms