Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUSP1P28562 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms