Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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