Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KALRNO60229 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KALRNO60229 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KALRNO60229 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KALRNO60229 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KALRNO60229 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms