Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNQ2O43526 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms