Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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