Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms