Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAGR1Q9BTK6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms