Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms