Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HLA-CQ95604 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms