Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF550Q7Z398 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms