Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BROXQ5VW32 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms