Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
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RTN1Q16799 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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RTN1Q16799 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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RTN1Q16799 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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RTN1Q16799 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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RTN1Q16799 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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RTN1Q16799 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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RTN1Q16799 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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