Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms