Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sem1P60897 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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