Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO1P25800 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO1P25800 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO1P25800 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO1P25800 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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